Métodos revolucionarios para el análisis de macromoléculas

Revolutionary methods for the analysis of macromoleculesMétodos revolucionarios para el análisis de macromolécula

Case Report: Resolution of submacular haemorrhage secondary to exudative age-related macular degeneration after a single intravitreal dobesilate injection

[Introduction] Submacular haemorrhage is not an unusual cause of acute central vision loss, particularly in older people. It may be caused by a number of conditions, most common of which is exudative age-related madular degeneration. In patients affected by this type of macular degeneration, choroidal neovascularization extends into the subretinal space, producing substantial bleeding in approximately 17% of cases, resulting in large haemorrhages in the subretinal space that detach the neurosensory retina from the supporting retinal pigment epithelial (RPE) layer. This leads to substantial vision loss because of a relatively fast process of extensive photoreceptor atrophy in the overlying neuroretina and formation of macular scars[Case presentation] We describe a patient with submacular haemorrhage secondary to exudative age-related macular degeneration, treated with intravitreal injection of dobesilate. Two months later, visual acuity in the treated eye reached 0.50 with a significant improvement of the distortion and an anatomical resolution of the haemorrhage, as confirmed by optical coherence tomography.[Conclusions] Submacular haemorrhage secondary to exudative age-related macular degeneration can be successfully treated with intravitreal dobesilate. To our knowledge, this is the first case reporting a resolution of submacular haemorrhage after a single dobesilate injection.We acknowledge support by the CSIC Open Access Publication Initiative through its Unit of Information Resources for Research (URICI)Peer reviewe

Crystallization and preliminary crystallographic studies of human kallikrein 7, a serine protease of the multigene kallikrein family

4 páginas, 6 figuras, 2 tablas -- PAGS nros. 669-672Hepatitis B core (HBc) particles have been extensively exploited as carriers for foreign immunological epitopes in the development of multicomponent vaccines and diagnostic reagents. Crystals of the T = 4 HBc particle were grown in PEG 20 000, ammonium sulfate and various types of alcohols. A temperature jump from 277 or 283 to 290 K was found to enhance crystal growth. A crystal grown using MPD as a cryoprotectant diffracted X-rays to 7.7 Å resolution and data were collected to 99.6% completeness at 8.9 Å. The crystal belongs to space group P212121, with unit-cell parameters a = 352.3, b = 465.5, c = 645.0 Å. The electron-density map reveals a protrusion that is consistent with the N-terminus extending out from the surface of the capsid. The structure presented here supports the idea that N-terminal insertions can be exploited in the development of diagnostic reagents, multicomponent vaccines and delivery vehicles into mammalian cellsWe thank Professor K. Murray for providing plasmid pR1-11E. X-ray data collection was supported by BM14UK/ESRF, Grenoble and SRS, Daresbury. WST was supported by a Die NorKen Stiftung Visiting Fellowship and KLH is the recipient of the Darwin Trust ScholarshipPeer reviewe

Ofloxacin-like antibiotics inhibit pneumococcal cell wall-degrading virulence factors

The search for new drugs against Streptococcus pneumoniae (pneumococcus) is driven by the 1.5 million deaths it causes annually. Choline-binding proteins attach to the pneumococcal cell wall through domains that recognize choline moieties, and their involvement in pneumococcal virulence makes them potential targets for drug development. We have defined chemical criteria involved in the docking of small molecules from a three-dimensional structural library to the major pneumococcal autolysin (LytA) choline binding domain. These criteria were used to identify compounds that could interfere with the attachment of this protein to the cell wall, and several quinolones that fit this framework were found to inhibit the cell wall-degrading activity of LytA. Furthermore, these compounds produced similar effects on other enzymes with different catalytic activities but that contained a similar choline binding domain; that is, autolysin (LytC) and the phage lytic enzyme (Cpl-1). Finally, we resolved the crystal structure of the complex between the choline binding domain of LytA and ofloxacin at a resolution of 2.6 Å. These data constitute an important launch pad from which effective drugs to combat pneumococcal infections can be developed. © 2005 by The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Inc.This work was supported in part by Ministerio de Educación y Ciencia (Spain) Grants BIO2001-1724 and BMC2003-00074. The costs of publication of this article were defrayed in part by the payment of page charges. This article must therefore be hereby marked “advertisement” in accordance with 18 U.S.C. Section 1734 solely to indicate this fact.Peer Reviewe

Estructura tridimensional de un fragmento de 3 Kda del factor derivado de Plaquetas-4 con actividad antiangiogénica e interacción con el factor de crecimiento para fibroblastos

Platelet-Factor-4 ís a protein belonging to the family of ELR negative CXC chemokines which binds to fibroblast growth factor, and inhibits its mitogenic activity.Platelet-factor-4 also inhibits tumor growth by mechanisms involving antiangiogenesis in which the blockage of fibroblast growth factor mitogenic activity seems lo play an essential role. Synthesis of platelet-factor-4 by recombinant technologies is a considerably cumbersome process that does not seen could sustain an industrial production of pharmacological-quoality because of platelet-factor-4 quaternary structure, and because the protein actívation requires an intramonomer Hydrolisys. It has been shown that the proteín's twenty-four residue C-terminal fragment is also antíangtogeníc in vitro and in vivio, forms a specific 1:1 complex with fibroblast growyh factors and decreases their affinity for their cell surface receptor. Thus this fragments seems could constitute an alternative to the use of the whole platelet-factor-4 for several of its uses therapeutic applications. The fragments preferential three-dimensional conformation in solutíon is quite stable and has been found to be composed of two helical sub-domains, which, both, seem required for inhihilion of fíbroblast growth factor dríven mitogenesis. The characterítation, at high resolution, of the three-dimensional structure of this fragment may contribute, to the understanding of the basis of its antiangiogenic activity, and thus, contribute, to the optimitation of their pharmacological properties. At the same time this structural characteritation may also contribute to a deeper perception of the platelet-factor-4 physiology.El factor derivado de plaquetas-a es una proteína perteneciente a la familia de las equemoquinas CXC, carentes de la secuencia ELR• . Esta proteína se une al factor de crecimiemo para Iibroblastos inhibiend o su actividad mitogénica. Así mismo se ha demostrado que inhibe el crecimiento tumoral a través de un mecanismo antiangiogénico en el que debe jugar un pa pel importante el bloqueo de la actividad del factor de crecimiento pura fibroblasros. El factor derivado de plaquetas-4 posee una estructura tridimensional complicada, por lo que es poco probable que puedan obtenerse cantidades industriales del producto, con calidad farmacológica, tanto por síntesis química como mediante ingeniería genética. Se ha demostrado que un fragmento equivalente a los veinticuatro residuos últimos del extremo carboxilo terminal de la proteína completa posee también actividad antíangiogñenica in vitro e in vivo, forma un complejo con estequiomelría 1:1 con el factor de crecimiento para fibroblastos y hace que disminuya su afinidad por su receptor de alta afinidad de la superficie celular. Este fragmento posee numerosas características para constituir un buen sustituto terapéutico de la proteína completa. La estructura tridimensional en solución de este fragmento es relativamente sencilla y notablemente estable. Consta de dos subdominios helicoidales que parece que es necesario que se mantengan unidos, tanto para la inhibición y la formación del complejo, como para que uno de los subdominios siga siendo helicoidal. La caracterización estructural a alta resolución de este fragmento puede contribuir a entender las bases estructurales de su actividad antiangiogéníca y, por tanto, podría permitir mejorar sus propiedad es fa rma co lógica s. A su vez puede ayudar a un a mejor comprensión de las bases estructurales de la fisiología del factor derivado de plaquetas-4

Riego deficitario en granado. Relaciones hídricas y crecimiento del fruto

Con la convicción de que los agrosistemas mediterráneos tienen que afrontar la necesidad de convivir con la escasez de agua, y que resulta muy difícil, si no imposible, poder satisfacer las necesidades máximas de agua de la mayoría de los cultivos; diseñamos un ensayo de riego deficitario (RD) en granado “Wonderful” bajo malla, para estudiar las relaciones hídricas y poder ajustar los volúmenes de riego y elegir la estrategia de manejo más adecuada bajo las condiciones de cultivo. El ensayo se inició en 2021 en una plantación de granado “Wonderful” bajo malla de sombreo 30%, perteneciente al Grupo Paloma (Mazarrón). Los árboles formados en vaso abierto y a marco de 5 m x 3,5 m, presentaban un diámetro de tronco entre 11,5 – 12,2 cm y un porcentaje de área sombreada del 43%. El riego por goteo constó de un único lateral por hilera de árboles y 3 emisores autocompensantes de 4 L/h por árbol. El agua de riego, de pozo, presentó un pH de 7,9, CE25ºC de 2,6 dS m-1 y una concentración de cloruros y sodio de 10,9 y 11,9 meq L-1 , respectivamente. Los tratamientos en curso son: i) control (CTL) con riego al 115% ETc, ii) riego deficitario sostenido (RD) regado al 75% CTL, iii) riego deficitario controlado (RDC) con riego al 40 – 100 – 70% CTL durante las fases: floración, cuajado y crecimiento inicial del fruto (junio) – tramo II de la fase de rápido crecimiento del fruto - fase final del período de crecimiento y maduración del fruto, y iv) finca (FCA) regado de acuerdo al criterio del técnico de la empresa. El diseño experimental es de bloques al azar y tres repeticiones por tratamiento. Los resultados de la campaña de riego actual, periodo marzo-primera semana de julio, indican un ahorro de agua respecto a CTL del 20; 25 y 53% para FCA, RD y RDC, respectivamente. La evolución del fruto y diámetro medio es similar en los cuatro tratamientos (d = 62 mm-DDA 187). Aunque no hubo diferencias de potencial matricial del agua en el suelo (m), debido a su alta variabilidad, si se dieron de potencial de tallo a mediodía (t) para RDC desde principios de junio hasta el cambio de riego al 100% de CTL, primera semana de julio. De igual modo que en m, no se observaron diferencias de conductancia estomática (gs) a excepción de los días previos al cambio de riego en RDC. Aunque son resultados preliminares y se requiere de los resultados que deriven de los años posteriores, éstos sugieren una buena adaptabilidad del granado al déficit hídrico, al mantener una evolución y tamaño de fruto similar, el cual es una de las principales características de calidad de la granada a nivel comercial. Dada la excelente aceptación de la variedad Wonderful para exportación, tanto el volumen de riego actualmente aplicado como las características principales del fruto son resultados alentadores

Semen-Derived Amyloid Fibrils Drastically Enhance HIV Infection

SummarySexual intercourse is the major route of HIV transmission. To identify endogenous factors that affect the efficiency of sexual viral transmission, we screened a complex peptide/protein library derived from human semen. We show that naturally occurring fragments of the abundant semen marker prostatic acidic phosphatase (PAP) form amyloid fibrils. These fibrils, termed Semen-derived Enhancer of Virus Infection (SEVI), capture HIV virions and promote their attachment to target cells, thereby enhancing the infectious virus titer by several orders of magnitude. Physiological concentrations of SEVI amplified HIV infection of T cells, macrophages, ex vivo human tonsillar tissues, and transgenic rats in vivo, as well as trans-HIV infection of T cells by dendritic or epithelial cells. Amyloidogenic PAP fragments are abundant in seminal fluid and boost semen-mediated enhancement of HIV infection. Thus, they may play an important role in sexual transmission of HIV and could represent new targets for its prevention

Los factores de crecimiento para fibroblastos: relaciones estructura-función en una familia peculiar de proteínas con pluriempleo

4 p.-1 fig.El concepto de pluriempleo aplicado a las proteínas es relativamente nuevo pero ayuda a explicar cómo sólo un 50% más de genes pueden dar lugar a diferencias tan enormes como las que se dan entre un hombre y un gusano. A lo largo de la evolución es obvio que los organismos se las han arreglado para ir desarrollando fisiologías cada vez más sofisticadas, aumentando al mínimo el número de genes que la sustentan. Para ello, los organismos, a medida que evolucionaban fueron desarrollando también una serie de mecanismos que les iban permitiendo sacar cada vez más partido a los genes que habían recibido de sus predecesores. De esta forma se ha llegado a extremos como el del hombre que con probablemente sólo treinta mil genes, puede dar cuenta de unas ciento cincuenta mil funciones bioquímicas diferentes, funciones que requieren siempre de la intervención específica de una proteína1. Uno de los recursos utilizados disponer de proteínas suficientes para llevar a cabo tantos procesos, economizando lo más posible en genes, ha sido pluriemplearlas.Peer reviewe